倪柝声弟兄的职事有确定的目标。他的职事是以基督为中心，并显于众地方召会。他职事的目标是要建立地方召会。他传扬福音，目的是产生材料以建造召会。他教导圣经、造就青年信徒、召开特会、带领训练、并出版文字，目标和盼望，都在于建造地方召会里团体的见证。我们读他的著作就能看出，关于这目标，他从主领受了清楚的异象和确定的使命。
在倪弟兄所著‘聚会的生活’一书的引言中，他着重的强调这目标：
…神在万古之先，有祂自己的旨意，有祂预定的计划，就是在神的目的中，要有一班人得祂的生命，像祂儿子一样。神的目的，是要建立基督。不只是建立个人的基督，也要建立团体的基督。这团体的基督，就是教会。由此可知神在今天最注意的，就是教会。可惜今天不只属肉体的信徒，不注重神所注重的，连属灵的信徒，也不注重神所注重的！他们常以许多的工作，来代替神的教会。
用某种工作来代替神的教会，是撒但今天叫人所作的。但是，我们知道，神的目的，从始至终，就是要得着一个团体的基督，就是教会，叫基督作元首，信徒作肢体。撒但一心要破坏这个计划，所以他叫人用一种工作，来代替教会。
今天有人顶注重传福音，以传福音代替教会。我们知道有许多人顶会传福音，顶会拯救罪人。传福音固然是好事；但是，若把传福音的工作，来代替教会，使人从来不想到教会，这就不免受撒但的欺骗。我知道我说这话，并非过重的。神所以要人传福音，不过是为教会预备石头。人若用传福音来代替教会，这就错了。
有人设立差会，鼓励国外布道，热心捐钱，设立协进部，设立国外布道的机关，打发人往国外布道。但是，今天为什么有许多人，只知有差会，不知有教会呢？这是因为：神从永世所注意的是教会，人今世所注意的是差会。许多人把教会忘记了！哥顿先生说：‘神从来不设立差会，神只设立教会。’但是，今天的人是设立差会，设立布道机关，设立学校，设立医院，设立勉励会、孤儿院等来帮助人；或者如监理会设立务德会来帮助人；又如有人设立主日学来帮助人。这些到底好不好呢？都好。但是，人把这些来代替神的教会，神就不能满意。你能看见撒但巧妙的手段么？撒但巧妙的手段，就是把神所用的工作，搬来代替神在祂永远的旨意中所要设立的教会。如果你的眼开了，你就看见这一切都当放下，而注意到教会。因为教会的生活，就是基督身体的生活，是神的目的。
许多基督人说，‘我们并未设立差会、勉励会、主日学、学校、医院等工作呀。’请你且慢这么说。在消极方面，你并未作这些错事，在积极方面，你作了什么呢？许多人想，我只要作热心、得胜、圣洁的基督人就好了。弟兄姊妹们，我说句重话，这些并非神所要的，并非神独一无二的目的。我也并非说，热心、得胜、圣洁，是不要紧的。这些都是要紧的。但是，神最终的目的，并不是这些。神是要团体的教会，是要房子，是要灵宫。神不是要零碎的，单独的，一砖，一瓦，一木，一石。神是要一个身体，不是要一个手指，或是一个肢体。神所要的是教会。神是要叫基督在教会中居首位，作元首。虽然木石砖瓦都是需要的，但这并非神的目的。你作基督人这么多年，曾用过多少工夫，来想神所要的是什么呢？你曾想过教会这件事么？或是你只想到，只注意到，我当怎样祷告，怎样胜过罪，怎样能领罪人得救，怎样就能好好读经呢？你所想的是这些呢？或是想到教会是什么呢？神所要的，是一个教会。凡赶不上这个的，都是赶不上神的目的。我并非说这些不好，我乃是说，凡赶不上教会的，都不算神的目的。如果主日学只是为主日学，孤儿院只是为孤儿院，勉励会只是为勉励会，传福音只是为传福音，不用这些来代替教会就好了。因为这些都赶不上神的教会。神所要的是教会。主耶稣的死是为教会，圣灵的来也是为教会。新约中自始至终，都能找到这原则：就是什么都是为着教会。就如：主死是为教会。以弗所书记着说：‘基督爱教会，为教会舍己。’主复活，远超过一切执政的，掌权的，在万有之上，为教会作万有之首。主把教会建立在这磐石上。圣灵的工作，在这二千年来，都是为着建立教会。神拯救罪人，使人得胜，是为建立教会。神赐下使徒，先知，传福音的，牧师教师等，是为建立教会。以弗所书说，主借着话，把教会洗净，成为圣洁，可以献给自己，作个荣耀的教会，毫无玷污皱纹等类的病，是圣洁无瑕疵的。这又是为着教会。神最终的目的，要得一新耶路撒冷，其所预表的就是教会。全旧约、新约、四福音、启示录所记载的神的目的，是为得着新耶路撒冷，就是为了教会。我顶重的说，我们今天的目的、工作、生活，若非为教会－就是要成功主所要得着的－我们就是大失败。愿主可怜我们，拯救我们，脱离我们微小的看法，进入主的目的中，进入圣经中神所注重的事。…
教会是神的目的。今天神就是把这目的放在人面前。神最终所要得的，是新耶路撒冷。神把新耶路撒冷所代表的教会作单位，放在每个城中。在神的目的中，当新耶路撒冷尚未从天而降之前，神要有一个新耶路撒冷的雏形在每一城中。就是神要有一个教会，在每一城中，来彰显祂永远的旨意。从起头到末了神所要作的最大的工作，就是建立基督的身体。所以神在每一个城中，设立地方的教会。这就是神伟大的教会的雏形，是小规模的彰显这新耶路撒冷。神的旨意，是为设立教会，就是基督的身体－新耶路撒冷。但这范围太大，我们怎能去摸到新天新地中的新耶路撒冷呢？我们怎么作法呢？我们抓不牢这个。但是，你能在上海来作。因为在每一城中都有一个雏形，神把得救的人，放在里面，叫他们都合在一起，聚集在一起，成功作一个地方的教会；这样就能彰显神的旨意。…
我不是在此控告你们，连我自己也在内。在中国这许多年传福音的工作中，很少有人注意神所注意的。天主教传至中国已有三百多年，若从景教算起，基督教在中国约有一千多年，但从来无人注意到小规模的发表神永远的旨意。就是我们也是如此。我们只注意到个人的胜罪、得胜、工作、救人等事。我们并未看见在一个地方，当如何发表神对于教会的旨意。但愿神施恩给我们，叫我们看见个人的胜罪、得胜、救人的工作，算不得什么。这一切不过是与本地聚会发生关系，这些并不能代替教会。因为神是以本地的教会为中心，其他都是要与这中心相联合。所以今天的问题，不是注意得胜、胜罪、传福音救人、祷告得答应，乃是进一步的问，我怎样能作到与别的弟兄姊妹配合得起来。…
所有的问题，不是在乎这石头好不好，大不大，好看不好看，乃是在乎这石头与别的石头配得好不好，能否合拼起来成一房子。今天许多基督人好真是好，有的顶光顶美，可是拼不起来。不是太大，就是太高，总是和别的基督人配不起来。我们每一个得救的人，就是活石。所以问题并非你得胜不得胜，有能力没有能力，好不好。问题乃在乎这些活石能否在众活石中，作一能与其他活石合得起来的人，作一配合的活石，不使在配合的地方和别的活石有裂缝。不然，就在神的家中，并无多大的用处。
在一九三五年七月所出版的‘通问汇刊’第十二期里公开的信中，倪弟兄又用以下简短有力的话强调这目标：‘我们所明白的就是神要我们显出基督生命于地方的教会中。所以，我们工作的实际，是基督的生命。我们工作的外表，是地方的教会。’
倪弟兄的职事为许多基督徒所接受，但他职事的目标为大多数人所弃绝。他们欣赏他生命的职事，但他们不愿顾到他建造地方召会的目标。有些人甚至认为他有这样的目标是错误的。但事实上，不是他错了，乃是他们没有看见主向他所启示的，就是神渴望使基督彰显在地方召会中。平心而论，在倪弟兄被主兴起的时候，成百万的基督徒当中有各种基督徒的工作，那里有一个在一里凭基督所建造，不带任何分裂元素的正确召会？在满了分裂与混乱的局面中，倪弟兄得着属天的异象，看见基督的身体，是要在每个地方的一个召会里将神的心意彰显出来。他是合乎神心意的人，向其他基督徒见证他所看见的异象，但在这事上他完全被误会并弃绝。其他的基督徒，因着他们在公会结构里强烈的背景，受了蒙蔽，看不见神心意的清楚异象。有些人批评他心地狭窄。有些人认为他是‘偷羊者，’有些人甚至控告他在召会的事上是错误的。事实上，他既不是心地狭窄，也不是错误的；他乃是忠心于他主人的目标，并且以他主人的目标为他职事的目标。他知道要付代价，也甘愿为此付代价。他甚至付上了生命的代价。他不关心别的，只关心他主人的心意，就是得着地方召会，团体的彰显祂。他不是‘偷羊者，’乃是作他主人，就是那爱召会，为召会舍了自己的那一位，真实的见证人。他无意建造自己的‘召会，’或为自己建造什么。他关心神的心意。他的心宽大，足以接纳神一切的儿女，尽管他被许多人误会并弃绝，他还是爱一切主所救赎的人。他深切渴望众人都得着亮光，看见主真正所要的，并照着主的心意寻求主。
倪弟兄照着主自己对召会的爱，照着他从主所得着的异象，对分裂的基督教作相反的见证，并且吹号叫所有真正寻求主的人离开公会的分裂，回到基督身体真正的一里，在各地团体的彰显基督。这是他整个职事的目标，并且他至死持守这目标。